Возможности этой проги дают убрать со скина рисунок маркером?

Есть инструмент ластик, но он сотрёт и то что было под маркером.

Если речь идет о том, чтобы стереть водяной знак с изображения, то эта программа вам в этом не поможет. В таких целях попробуйте воспользоваться Adobe Photoshop или его онлайн версией. Как убрать водный знак в этой программе можно посмотреть в интернете - уроков бесчисленное множество и все крайне просты.