что лучше и почему?

uTorrent 3.4.0 - последняя версия на данный момент.
Использование последней версии, как правило, является стандартным решением.
В случае, если стабильно устанавливаться новая версия не хочет, то можно попробовать в качестве эксперимента установить старую версию.
Предварительно удалив программу через Панель управления.

По вашей просьбе даю ответ для "чайника".
Поскольку особых отличий между ними в плане функциональности вы, скорее всего, не найдёте, то лучшей из этих версий будет та, которая лучше всего будет работать на вашей системе. Подчёркиваю - не у "друга/соседа" и т.п., а именно у вас. И тут решить можно только методом проб.

Как правило, пробы рекомендуется начать с самой свежей версии. Если с ней всё в порядке, всё стабильно, и ничего не глючит, все функции работают, клиент нормально качает и раздаёт, то на этом можно успокоиться. Если что-то не так, то стоит эту версию удалить и пробовать более старую.
Суть в том, что µTorrent выпускает новые версии сравнительно часто, и иногда они бывают сырыми и глючными. Специально исправлять в них ошибки никто не будет. Придётся дожидаться новой версии, в которой эти ошибки исправят (и добавят новые). Или установить какую-либо старую версию, которая у вас раньше нормально работала.

Далее. Советы:
1. Настоятельно рекомендую сразу залезть в настройки µTorrent и отключить автоматическое обновление программы. Причину см. выше. Обновляться (если очень уж хочется) только вручную, либо не обновляться вообще.
2. У большинства версий µTorrent (но не у всех) при обычном удалении программы через Панель управления её настройки остаются в системе. И если глюки удаляемой версии были связаны с кривыми настройками, то велик риск, что они подхватятся и на новой установке. Если требуется это гарантированно исключить при последующих пробах, то удалять предыдущую версию нужно через программы-деинсталляторы типа Revo Uninstaller, выбирая режим полной деинсталляции. При этом следует учесть, что в этом случае можно заодно и удалить торрент-файлы недокачанных раздач и ещё что-нибудь нужное. Будь внимательнее.
3. Рекомендую переименовать файл программы, скачанный с нашего портала, либо с официального сайта, добавив в его название точный номер версии. И файлик этот сохранить в укромном месте своего компьютера - возможно, в процессе проб или после переустановки системы вам ещё не раз придется к нему обратиться. А номер версии в названии поможет ориентироваться.

UP. Лично у меня, например, был период, когда после долгих и безуспешных проб различных 3-их версий я в конце-концов установил версию 2.2.1, которая благополучно и без малейших нареканий отработала многие месяцы. Надеюсь, что и вы свою "идеальную "версию тоже найдёте.