23.02.2015 17:35
Хотелось бы узнать больше подробностей о проекте. Звуковая дорожка уже добавляется в проект совместно с видеоматериалом, или же накладывается уже в процессе из отдельного файла? Теоретически, возможна нехватка производительности в процессе рендеринга, отсюда и рассинхрон. Приведите характеристики своего компьютера.
Постарайтесь не нагружать его больше ничем на время обработки видео. Почистите кэш, освободите оперативную память, исключите лишнее обращение к жёсткому диску. Есть смысл изменить настройки качества и проверить на более низких, сохранится ли рассинхрон. В-общем, необходимо экспериментировать.